জনসন অ্যান্ড জনসনের টিকাটি একের পর এক বিতর্কে জর্জরিত হয়েছে। চলতি বছরের ১ এপ্রিল, মার্কিন সরকার ভ্যাকসিনটি দেওয়া বন্ধ করে দিয়েছিল। বেশ কিছু ক্ষেত্রে ভ্যাকসিন নেওয়ার পর রক্ত জমাট বাঁধার অভিযোগ েসেছিল। টিকা নেওয়ার দুই সপ্তাহের মধ্যেই অভিযোগগুলি উঠেছিল। সেগুলি নিয়ে তদন্তের পর ২৩ এপ্রিল মার্কিন স্বাস্থ্য বিভাগের বৈজ্ঞানিক উপদেষ্টাদের সিদ্ধান্ত অনুযায়ী ফের টিকাটিকে ছাড় দেওয়া হয়।
আবার, সোশ্যাল মিডিয়ায় দাবি করা হয়েছিল ভ্যাকসিনটিতে গর্ভপাতিত ভ্রূণের ডিএনএ অন্যতম উপাদান হিসাবে ব্যবহার করা হয়েছে। েরপর নিউ অরলিন্সের রোমান ক্যাথলিক চার্চ নৈতিকতার প্রশ্ন তুলেছিল। পরে সংস্থার পক্ষ থেকে জানানো হয়, ভ্যাকসিনটিতে ভ্রূণ কোষের গবেষণাগারে তৈরি প্রতিরূপ ব্যবহার করা হয়, ভ্রূণ কোষ নয়।
এছাড়া, সাম্প্রতিককালে এমন বেশ কিছু প্রতিবেদন এসেছে, যা বলছে টিকাকরণের ৪২ দিনের মধ্যে ভ্যাকসিনটি গুলেন-বারি সিনড্রোমের ঝুঁকি তৈরি করে। তরে ভ্যাকসিনটির জন্যই ব্যাধিটি দেখা দিচ্ছে, েমন কোনও কার্যকারী প্রমাণ পাওয়া যায়নি।