যদিও বর্তমান ভারতীয় ক্রিকেট দলকে কঠোর খাদ্যাভাসের অনুসরণ করতে হয়, তবে ধোনি এক্ষেত্রে কিছুটা দুর্বল। একটি সাক্ষাত্কারে, ধোনি প্রকাশ করেছেন যে তিনি খাদ্য প্রেমিক, এবং তার প্রিয় খাবারের মধ্যে মুরগির মাখনের রস, কাব্যাব এবং মুরগির টিক্কা, পিজা ইত্যাদি।