এলার্জির সমস্যা দেখা দিতে পারে অধিক টমেটো খেলে। এতে থাকে হিস্টামিন নামে উপাদান থাকে যা। যা অধিক পরিমাণে খেলে শরীরের ক্ষতি হতে পারে। তেমনই হতে পারে মুখ ফোলা, জিভে সমস্যা, হাঁচি ও গলা ব্যথার মতো সমস্যা দেখা দেয়। আর যাদের এলার্জির ধাত আছে, তারা ভুলেও খাবেন না টমেটো। অধিক পরিমাণে টমেটো ক্ষতি করবে।